服务支持
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Q.
在市场上目前广泛开展的分子检测中,哪些具体应用是非常适合在核酸质谱平台上开展的?
A.

已知明确的位点信息,以及位点与生物学意义之间的关联,且目标位点数量在十几个到100个范围内的应用。例如:耳聋基因筛查、SMA携带者及新生儿筛查、精神类药物代谢基因检测、心血管药物风险评估与精准用药、儿童安全用药检测、多重病原微生物检测、稀有血型分型、DTC基因检测等。


Q.
NGS平台的检测成本越来越低,一次检测还能获得更多的数据量,为什么要选择核酸质谱?
A.

NGS技术的低检测成本,源自越来越大的检测通量,和相关试剂的国产化。在试剂成本一定的前提下,一次开机检测的样本量越大,每个样本的成本越低。这就意味着为获取更低的检测成本,需要将大量来源不同、检测目的、类型不同的样本混合建库,这就大大增加了实验流程中的不确定性。不同样本的定量是否一致、获得数据的准确性是否能够保证都成为不确定因素。目前国内几家NGS服务商巨头已经具备这种混合样本文库建库、检测、及分析数据的能力。但如果是某客户准备购买一台NGS并计划在其上开展多种应用的话,首先样本量不够多,则无法实现低成本;其次将不同类型样本不同类型检测放在同一个Run做,则会面临实验流程和数据处理的高度复杂,同时准确性也无法保证。

除了检测成本的问题,NGS整个实验流程极其繁琐,对操作人员的要求非常高,操作人员的经验很大程度上决定了检测结果是否理想。实验流程进一步决定了NGS出报告的时间至少要2-3天(如加上凑样本所需时间,可能会一周或更长)。另外就是NGS的数据解读需要生物信息专业背景的人员才能进行。

所以如果客户在待开展项目上已有一定计划,根据其检测样本量,如果达不到NGS的高度,那么核酸质谱才是他们更好的选择。

Q.
核酸质谱在临床相关分子检测中的特点是什么?
A.

1.多重检测:在单个反应孔中能够实现10-40重的扩增和单碱基延伸,在MA4质谱仪中同时对多个位点进行检测。

2.自动化程度高:手动操作时间在半小时以内,MassARRAY CPM系统将点样和质谱检测整合一体,无需人工手动点样,大大简化实验流程。

3.从样品到报告周期短:从DNA样本到得到结果数据可在8小时内完成。

4.高通量:每天可运行10块96孔芯片或8块384孔芯片。日处理样本量最高可达3072份。

5.数据结果无需生物信息学解读获得的数据结果直观易懂,直接获得检测位点的基因型信息,无需生物信息学背景即可分析。

6.高度灵活:Panel中的位点可灵活增减,位点的增加只需另外合成引物,无其他成本增加。芯片的使用无需凑样本数,没有用完的孔,在一定时间内继续使用即可(按要求保存好芯片)。无需一次做满整张芯片。

7.样本兼容性高:多种来源的DNA均可满足检测需要,包括全血、血浆、干血斑、唾液、口腔拭子、精液、尿液、FFPE、新鲜组织、cfDNA等样本类型。DNA用量低,每个反应仅需5-10ngDNA;发生一定降解或片段化的DNA样本也能满足检测需求。

8.检测成本低:单个反应孔的试剂耗材成本是固定的,不会受检测样本量的多少影响。每个反应中能够同时检测几十各位点,分担到每个位点上的成本就更低了。

Q.
MALDI-TOF MS的基本原理是什么?
A.

 MALDI-TOF中的MALDI即为质谱的离子源部分,TOF即为质谱的质量分析器部分。

离子源工作原理:

首先,MALDI-TOF MS需要基质参与电离的过程,基质多为具有很强激光能量吸收能力的有机酸,其主要作用为增强样品对激光的吸收,降低激光对样品的破坏。样品与基质混合结晶后,在激光的照射下基质迅速蒸发,基质和样品分子间作用力快速削弱,使得样品分子被释放出来,同时,基质可将吸收到的激光能量传递至样品分子并使其电离。因此MALDI技术属于光子激发的表面解吸离子源,其能量由激光的光子提供。MALDI电离技术灵敏度极高,仅需pmol-fmol级别的微量样本即可进行检测。

飞行时间质量分析器(TOF MS)原理:

飞行时间质量分析器是通过间歇式的脉冲电场对离子化的样品进行加速,然后不同分子量的离子在真空飞行管内以各自不同的恒定速度飞向离子检测器。由于真空管内离子飞行速度与其质荷比(m/z)的平方根成反比,不同质荷比的离子到达检测器的飞行时间不同,从而可以区分出样品中具有不同分子量的物质。理论上,TOF分析器的相对分子量检测范围为0到无限大,但在实际基因检测应用中,该检测范围多限制在1000-10000Da这个区间内。